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PDBbrowseは,ブルックヘイブン・プロテイン・データ・バンクのグラフィック・インターフェースです
D R Stampf1, C E Felder, J L Sussman
1Department of Chemistry, Brookhaven National Laboratory, Upton, New York 11973, USA.
Nature
|April 6, 1995
まとめ
タンパク質データバンクのアーカイブは,UNIXのワークステーションで検索し,閲覧できるようになりました. ユーザーはシンプルなコマンドで3Dタンパク質構造に簡単にアクセスし,表示することができます.
科学分野:
- 構造生物学 構造生物学とは
- バイオインフォマティックス
- コンピュータ生物学 コンピュータ生物学
背景:
- タンパク質データバンク (PDB) は,実験的に決定された3次元分子構造の重要なリポジトリです.
- 複雑なタンパク質構造にアクセスし視覚化するには,歴史的に特殊なソフトウェアと重要なコンピューティングリソースが必要でした.
研究 の 目的:
- タンパク質データバンクアーカイブのアクセシビリティと使いやすさを向上させる.
- 3Dタンパク質構造の簡単な検索と視覚化を可能にします.
主な方法:
- UNIX ワークステーションでユーザーフレンドリーなインターフェースの実装.
- データ検索と表示のための直感的なキーストロークとマウス駆動コマンドの開発.
主要な成果:
- タンパク質データバンクのアーカイブ全体が,インタラクティブな探査のために今すぐ利用できます.
- ユーザーは,特定の3次元タンパク質構造を効率的に検索し,表示することができます.
結論:
- タンパク質データバンクへのアクセスの簡素化は,構造生物学および関連分野の研究を容易にする.
- この進歩は,研究者がタンパク質の構造とその機能を研究するための障壁を下げています.