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バクテリアのプロモーターにおける第3の認識要素:RNAポリメラーゼのアルファサブユニットによるDNA結合

W Ross¹, K K Gosink, J Salomon

¹Department of Bacteriology, University of Wisconsin-Madison 53706.

Science (New York, N.Y.)

|November 26, 1993

まとめ

UP要素は,ATに富んだDNA配列であり,RNAポリメラーゼのアルファサブユニットと直接相互作用することによって,細菌の転写を大幅に強化します. この相互作用は,標準的な-10と-35の領域を超えて,プロモーターの認識に不可欠です.

科学分野:

分子生物学は分子生物学である.
遺伝学遺伝学とは
バイオケミストリーバイオケミストリー

背景:

Escherichia coli の rrnB P1 プロモーターには,上流の活性化 (UP) 要素が含まれています.
このATに富んだDNA配列は,RNAポリメラーゼによる転写開始を強化する.

研究の目的:

UP要素が転写を刺激するメカニズムを調査する.
UP要素の相互作用に責任を負うRNAポリメラーゼの特定の成分を特定するために.

主な方法:

RNAポリメラーゼのアルファサブユニットのサイト指向型変異.
インビトロとインビボの転写アッセイ.
DNase Iの足跡の実験でした.
タンパク質とDNAの相互作用を研究するための電泳運動シフトアッセイ (EMSA)

主要な成果:

アルファサブユニットのC末端領域の突然変異は,UP要素依存型転写刺激を廃止しました.
ミュータントRNAポリメラーゼは,フットプリントアッセイでUP要素への結合が低下したことを示した.
精製されたアルファサブユニットはUP要素に直接結合し,認識におけるその役割を確認します.

結論:

UP要素は,RNAポリメラーゼのアルファサブユニットと相互作用する第3のプロモーター認識部位を表します.
この相互作用は,シグマサブユニットの -10 と -35 の領域との相互作用とは異なる.
UP要素は,プロカリオットプロモーターの上流にあるAT豊富な配列の流行を説明し,UP要素の機能と転写因子の活性化との関連を示唆する可能性がある.

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