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酵母C6亜鉛クラスタータンパク質の結合部位特異性の決定因子

R J Reece¹, M Ptashne

¹Department of Biochemistry and Molecular Biology, Harvard University, Cambridge, MA 02138.

Science (New York, N.Y.)

|August 13, 1993

まとめ

C6亜鉛クラスターファミリーの酵母転写活性化剤は,タンパク質とDNAの接触ではなく,異なる距離によってDNA部位を区別します. 特定の領域は,これらのタンパク質を好みのDNA配列に誘導する.

科学分野:

分子生物学は分子生物学である.
遺伝学遺伝学とは
バイオケミストリーバイオケミストリー

背景:

DNA結合タンパク質は,しばしば類似のDNA配列を認識する.
関連するDNA部位を区別することは,遺伝子調節において極めて重要です.
イーストの転写活性化剤のC6亜鉛クラスターファミリーは,DNA結合タンパク質として知られています.

研究の目的:

C6亜鉛クラスタータンパク質が関連するDNA結合部位を区別するメカニズムを調査する.
DNAサイト認識特異性に関与する特定のタンパク質ドメインを特定する.

主な方法:

C6亜鉛クラスタータンパク質のDNA結合特異性の分析.
核酸トリオットと間隔を注意してDNA結合部位の比較.
亜鉛クラスターおよび隣接する領域を含むタンパク質ドメインの機能分析.

主要な成果:

C6亜鉛クラスタータンパク質は,保存されたCGG...CCG三重体を持つDNA部位を認識しますが,間隔は異なります.
亜鉛クラスタードメインは,これらの保存されたトリプルツインを認識するために互換性があります.
リンカーと二分化要素を含む亜鉛クラスターのC端末領域は,DNAサイト偏好を決定する.

結論:

C6亜鉛クラスターファミリーは,変異したタンパク質-DNA接触ではなく,DNAサイト間隔を配列差別のために利用しています.
リンカーと二酸化エレメント領域は,これらの酵母転写活性化剤におけるDNA結合特異性の重要な決定因子である.

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