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レトロポゾンから得られた分子証拠は,クジラが平足の類動物の中でクラードを形成していることを示している

M Shimamura¹, H Yasue, K Ohshima

¹Faculty of Bioscience and Biotechnology, Tokyo Institute of Technology, Kanagawa, Japan.

|August 14, 1997

まとめ

クジラの進化の研究は,彼らの最も近い親戚を明らかにしています. ゲノムの短い間隔要素 (SINEs) は,クジラ,ヒッポ,および反動物が共通の祖先を共有していることを示し,平足の類動物に関する以前の分類に挑戦しています.

科学分野:

進化生物学の進化生物学について
ゲノミクスゲノミクスとは
分子系遺伝学分子系遺伝学

背景:

陸上の哺乳類からセタセア (クジラ,イルカ,海豚) の進化的起源は,研究の重要な分野である.
古生物学と形態学データを含む以前の研究は,セタセアの最も近い親類がアルティオダクティラ (均指の爪類) の内にあることを示唆しています.
分子解析により,アルティオダクティラの伝統的なモノフィレティック状態が疑問視され,類の関係に関するさらなる調査が求められました.

研究の目的:

ゲノムデータを用いてクジラ,ヒポポタム,反動物,豚の遺伝関係を調査する.
遺伝学的なマーカーとして,移動的な遺伝的要素,特に短い間隔の要素 (SINEs) を識別し,特徴づけること.
セタセアとアーティオダクティラとの間の進化的分岐イベントを解決するために.

主な方法:

短い間隔元素 (SINEs) の特定のファミリーに関する全ゲノム調査.
異なる種のゲノムにわたるSINE単位の逆位イベントの分析.
特徴的なSINE挿入の有無を基にした系統遺伝分析.

主要な成果:

SINEsの2つのファミリーは,鯨,反動物,河馬のゲノムにおいてのみ特定されました.
SINEユニットの9つの異なる逆位イベントが特徴付けられ,系統遺伝的解像度を提供しました.
これらのSINEsの分布は,クジラ,反動物,そしてヒポポタムスのモノフィレティックな集団を支えている.

結論:

この発見は,クジラ,反動物,ヒポポタムスがモノフィレティック群を形成するという強力な分子証拠を提供します.
これは,アーティオダクティラ (Artiodactyla) についての伝統的な見解に異議を唱え,鯨類の起源に関する私たちの理解を洗練します.
SINEsは,哺乳類の秩序内の深い進化的関係を解決するための効果的なマーカーです.

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