通过跨物种序列比较来识别4,13,和5型白细胞间蛋白的坐标调节剂
G G Loots1, R M Locksley, C M Blankespoor
1Genome Sciences Department, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA 94720, USA.
Science (New York, N.Y.)
|February 7, 2001
概括
研究人员在人类和小鼠基因组之间确定了保存的非编码元素. 一个元素调节多个免疫基因,为基因调节提供了洞察力.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 分子生物学分子生物学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 发现远程监管要素在实验上具有挑战性.
- 跨物种保存的序列可以表明功能重要性.
研究的目的:
- 在人类和小鼠基因组之间识别保存的非编码元素.
- 描述这些元素的功能.
主要方法:
- 对1兆基的正确人类和小鼠序列进行比较基因组学分析.
- 保存的非编码元素的识别 (>70%的标识超过>=100 bp).
- 使用酵母人工染色体转基因小鼠进行功能性表征.
主要成果:
- 确定了90个保存的非编码元素.
- 大约70%的分析元素显示了跨哺乳动物的保护.
- 发现的最大元素协调了120kB以上的三个免疫基因 (互白素-4,-13,和-5).
结论:
- 跨物种序列比较是发现远程监管要素的有效策略.
- 发现了一种控制关键免疫基因的新型远程调节元件.
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