来自历史标本的爱尔兰土豆饥荒病原体的PCR放大

科学领域:

• 植物病理学 植物病理学
• 分子遗传学分子遗传学
• 历史植物学历史植物学

背景情况:

• 晚期腐烂病是由Phytophthora infestans引起的,摧毁了土豆作物,特别是引发了1845年爱尔兰土豆饥荒.
• 在20世纪80年代之前,Phytophthora infestans种群主要是US-1基因型 (Ib线粒体DNA单双型),性繁殖仅限于墨西哥.

研究的目的:

• 确认P. infestans在1840年代的历史草本馆样本中的身份.
• 重新评估关于P. infestans祖先菌株及其在早期流行病中的作用的理论.

主要方法:

• 从28个历史草本实验室样本 (1845-1847) 中,对内部转录间隔区域2的DNA放大和测序.
• 变量线粒体DNA区域的放大,以区分P. infestans单元型 (Ib, Ia, IIa, IIb).

主要成果:

• 从1845年至1847年的历史P. infestans样本使用DNA测序得到证实.
• 这些历史样本中的病变并不是由Ib单本型引起的,这挑战了现有的理论.
• 在这些历史样本中缺少现代Ib单元型中存在的可变mtDNA区域.

结论:

• 在分析的历史样本中,US-1基因型 (Ib mtDNA单双型) 不是导致晚期病变的原因.
• 这些发现需要重新评估有关祖先P. infestans菌株及其在历史流行病中的作用的理论.
• 历史标本对于准确推断过去的病原体种群和进化历史至关重要.