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转录因子IIIA的替代的指3:通过 (31) P ENDOR光谱检测到与同源DNA的相互作用.

Charles J Walsby1, Dmitriy Krepkiy, David H Petering

  • 1Department of Chemistry, Northwestern University, Evanston, IL 60208-3113, USA.

Journal of the American Chemical Society
|June 19, 2003
PubMed
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此摘要是机器生成的。

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这项研究使用电子核双共振 (ENDOR) 来研究 (II) (Co) 在指域中的. 结果显示,Co (II) 在DNA结合中模仿 (II) (Zn (II)),与相似距离的酸盐结合.

科学领域:

  • 生物物理学的生物物理.
  • 生物有机化学 生物有机化学
  • 结构生物学 结构生物学

背景情况:

  • 指域是关键的DNA结合蛋白.
  • 的 (II) (Co) (II)) 替代是研究这些领域的常见技术.
  • 原型转录因子IIIA (TFIIIA) 及其指3 (F3) 域提供了一个模型系统.

研究的目的:

  • 描述一个生物系统中高旋转CO2的协调环境.
  • 为了研究Co(II) 替代的Finger 3 (Co(II) -F3的DNA结合特性.
  • 为了比较Co (II) -F3与DNA的结合,与Zn (II) -F3.3的结合.

主要方法:

  • 使用了电子核双共振 (ENDOR) 光谱法.
  • 1H,14N和31P ENDOR被用来探测连接体相互作用和距离.
  • 对来自Xenopus laevis TFIIIA的Cys2/His2指域 (F3) 进行了研究.

主要成果:

  • 恩多尔发现了Co (II) 与其氨基和氨基连接体之间的高协同性,类似于Zn (II).
  • Co(II) -F3证明了对5SrRNA的C块的序列特异性DNA结合,反映了Zn(II) -F3的行为.

相关实验视频

  • 在Co(II) 和最近的DNA基之间测量了8.13) Å的距离,无机酸盐与相似距离的距离结合.

    • 结论:

    • 在指领域中,Co(II) 替代是研究Zn(II) 的有效方法.
    • Co(II) -F3 特定于DNA序列的结合,证实其作为Zn(II) 模仿剂的实用性.
    • 无机酸盐与DNA竞争结合Co (II) 位点,这表明有一个共享的结合口袋.