通过指纹识别酵母人工染色体,绘制全人类基因组的地图
C Bellanné-Chantelot1, B Lacroix, P Ougen
1Centre d'Etude du Polymorphisme Humain, Paris, France.
Cell
|September 18, 1992
概括
大插入酵母人工染色体 (YAC) 能够实现全基因组物理映射方法. 这项研究汇集了1000多个结合物,涵盖了人类基因组的重要部分.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 分子生物学分子生物学
- 人类遗传学 人类遗传学
背景情况:
- 以前的人类基因组物理映射依赖于染色体特定的策略.
- 为了有效地绘制地图,需要采用全面的全基因组方法.
研究的目的:
- 用酵母人工染色体 (YACs) 证明全基因组物理映射策略的可行性.
- 为了组装和验证人类基因组覆盖范围的大型基因组结合物.
主要方法:
- 利用了 22,000 个大型插入酵母人工染色体 (YAC),平均大小为 810 kb.
- 用LINE-1 (L1) 探测器检测到的限制片段模式进行指纹YAC.
- 组装了1000多个结合物,并通过光,现场杂交和Alu之间的PCR验证了选择的结合物.
主要成果:
- 从指纹YACs成功组装了1000多个contigs.
- 通过细胞遗传和分子方法验证的结合物.
- 估计15-20%的人类基因组覆盖率,特别是L1丰富的区域,共超过3 Mb.
结论:
- 酵母人造染色体 (YACs) 为整个基因组物理映射提供了一个可行的平台.
- 这种方法显著提高了人类基因组物理测绘工作的规模和效率.
