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循环长度依赖于G-四重复的折叠.

Pascale Hazel¹, Julian Huppert, Shankar Balasubramanian

¹Cancer Research UK Biomolecular Structure Group, The School of Pharmacy, University of London, 29-39 Brunswick Square, London WC1N 1AX, UK.

Journal of the American Chemical Society

|December 17, 2004

概括

DNA四重复结构受到循环长度的影响. 较短的循环有利于平行结构,而较长的循环允许平行和反平行折叠,多个形状可能共存.

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科学领域:

生物化学生物化学
结构生物学结构生物学
计算化学计算化学

背景情况:

富含关氨酸的DNA序列形成了多样化的四重复结构.
四重复结构在线程极性,循环组成和形状上有所不同.

研究的目的:

建立基于循环长度预测分子内四重复结构的指导方针.
要了解循环长度如何影响四重折叠.

主要方法:

实验技术:循环二元化 (CD) 和紫外线化.
计算技术:分子建模和模拟.

主要成果:

一个平行链的分子内四重复是唯一可能的折叠,有三个单一残余循环.
平行和反平行四重复结构都可以形成,当循环长于两个残留物或包括单个胺残留物时.
具有相似自由能量的多重构造可能在溶液中共存.

结论:

循环长度是DNA四重折叠的一个关键决定因素.
对DNA四重复结构的预测指南可以从循环长度分析中得出.
多重构造的共存是溶液中的分子内四重复的关键特征.