用微阵列预测癌症结局:多重随机验证策略
Stefan Michiels1, Serge Koscielny, Catherine Hill
1Biostatistics and Epidemiology Unit, Institut Gustave Roussy, Villejuif, France.
Lancet (London, England)
|February 12, 2005
概括
使用DNA微阵列基因表达概况的癌症结果预测是不可靠的. 分子签名不稳定,经常错误地分类患者,质疑许多已发表的研究的预后价值.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 生物信息学是一种生物信息学.
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 使用DNA微阵列的基因表达概况旨在预测癌症预后.
- 识别分子签名可以根据疾病严重程度个性化癌症治疗.
研究的目的:
- 通过使用DNA微阵列,重新分析7项大规模预测癌症预后的研究数据.
- 评估分子特征的稳定性和分类准确性.
主要方法:
- 通过使用多个随机训练和验证集来扩展标准策略.
- 评估了已识别的分子特征的稳定性及其错误分类率.
主要成果:
- 癌症预后的分子特征高度不稳定,并且取决于训练组的组成.
- 大多数研究显示过度乐观的结果由于不充分的验证;七项研究中的五项没有比机会更好.
- 错误分类率通常随着训练集大小的增加而下降.
结论:
- 在癌症中发表的DNA微阵列研究的预后价值应谨慎解释.
- 建议使用重复随机抽样进行验证,以确保可靠性.
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