在患有结直肠癌的患者中检测MLH1和MSH2突变的转化分析

科学领域:

• 遗传学 是一个遗传学.
• 在瘤学瘤学.
• 分子生物学分子生物学

背景情况:

• 在不匹配修复基因中精确识别生殖系突变对于结直肠癌管理至关重要.
• 传统的DNA测序单独往往无法检测异质不匹配修复突变的全谱.

研究的目的:

• 为了比较转化分析与DNA测序在检测结直肠癌患者MLH1,MSH2和MSH6异质生殖系突变中的有效性.

主要方法:

• 一项多中心研究分析了来自患者的样本,这些患者很可能携带不匹配修复生殖系突变.
• 用转换分析和基因组DNA测序来进行突变检测.
• 分析了64例遗传性非多重症结直肠癌病例,8例遗传性非多重症结直肠癌类病例和17例早期发病病例的数据.

主要成果:

• 基因组DNA测序确定了各种突变,包括外子突变,删除,误解变化和拼接位突变.
• 转换分析检测到通过DNA测序发现的所有突变,以及额外的外基因突变,大型基因组删除和外基因重复,使有害突变的产量增加了33%.
• 转换分析显示,4个错误的变化导致了前子跳转,17个拼接位突变影响了拼接或mRNA稳定性,导致诊断产量的整体增加56%.

结论:

• 结直肠癌中不匹配修复突变是高度异质的,许多被传统的DNA测序遗漏.
• 转换分析大大提高了诊断产量,用于检测结直肠癌患者的不匹配修复基因突变.