猿类泡病毒和灵长类动物的古代共同物种化
William M Switzer1, Marco Salemi, Vedapuri Shanmugam
1HIV and Retrovirology Branch, Division of HIV/AIDS Prevention, National Center for HIV, STD, and TB Prevention, Centers for Disease Control and Prevention, 1600 Clifton Road, MS G-19, Atlanta, Georgia 30333, USA. bis3@cdc.gov
猿类泡病毒 (SFV) 与旧世界灵长类动物共同分类,为长期的病毒宿主共同分类提供了罕见的证据. 这些古老的RNA病毒非常缓慢地进化,这表明它们有3000万年的共同历史.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 进化生物学 进化生物学
- 灵长类动物遗传学
背景情况:
- 寄生虫及其宿主同时进化的共同物种化是一种假设的,但很少得到证实的进化模式.
- RNA病毒通常表现出快速的进化和频繁的跨物种传播,使得共同物种化不常见.
- 猿类泡病毒 (SFV) 是一种广泛传播的非致病性逆转录病毒,感染所有灵长类动物.
研究的目的:
- 为了研究同类泡病毒 (SFV) 和它们的灵长类宿主之间的共同物种化假说.
- 确定SFV及其灵长类宿主的进化史和分歧时间.
- 评估与其他RNA病毒相比,SFVs的进化速度.
主要方法:
- 对SFV聚合酶和灵长类线粒体细胞氧化酶II (COII) 亚单元基因进行比较的基因分析.
- 利用分子时钟校准来估计分离时间和进化速率.
- 分析了来自非洲和亚洲子和人猿的病毒和宿主遗传数据.
主要成果:
- SFV及其灵长类宿主的遗传树在分支顺序和分歧时间方面表现出了显著的一致性.
- 分子时钟分析显示,SFV的进化速率异常低 (每年每站点1.7 x 10^-8个替代).
- 确定SFV是迄今为止记录的最慢进化的RNA病毒.
结论:
- 同等的族系强烈支持SFV和旧世界灵长类动物之间的长期共同物种化事件.
- SFVs可能代表已知最古老的脊椎动物RNA病毒,其共同的进化历史至少延伸到3000万年.
- SFVs的缓慢进化速度促进了它们与灵长类宿主长期的关联和共同物种化.
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