10个人类染色体的转录地图以5核酸分辨率
Jill Cheng1, Philipp Kapranov, Jorg Drenkow
1Affymetrix Inc., Santa Clara, CA 95051, USA.
Science (New York, N.Y.)
|March 26, 2005
概括
没有注释的非多基化转录是人类基因组的主要输出. 这些与多基化转录一起,形成了影响基因调节和基因型-表型关联的复杂网络.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 分子生物学分子生物学
- 文字转录学 (Transcriptomics) 是一个学科.
背景情况:
- 人类基因组的转录输出是复杂的,并未完全理解.
- 描述RNA转录的全谱对于理解基因组功能至关重要.
研究的目的:
- 在人类染色体中绘制多基和非多基RNA转录的精确位置.
- 量化人类基因组中不同转录类型 (多基,非多基,双形) 的比例.
- 调查转录序列的核定位和注释状态.
主要方法:
- 高分辨率 (5基对) 绘制RNA转录部位的地图.
- 在8个不同的细胞系中分析了10个人类染色体.
- 基于多基化状态和注释的转录的分类.
主要成果:
- 没有注释的非多基化转录构成了人类基因组转录输出的最大部分.
- 多基化,非多基化和双形转录分别占所有转录序列的19.4%,43.7%和36.9%.
- 大约一半的所有转录序列是核的,并且在很大程度上没有说明.
结论:
- 人类基因组的转录区域是复杂的,由注释和未注释的转录编织在一起的网络.
- 这种复杂的组织对理解基因表达调节有重大影响.
- 这些发现需要重新评估基因型-表型关联以及基因的基本定义.
