完整的GroEL基底复合体的并列质谱检测揭示了基底特异性转环形状变化
Esther van Duijn1, Douglas A Simmons, Robert H H van den Heuvel
1Department of Biomolecular Mass Spectrometry, Bijvoet Center for Biomolecular Research and Utrecht Institute for Pharmaceutical Sciences, Utrecht University, The Netherlands.
Journal of the American Chemical Society
|April 6, 2006
概括
细菌GroEL chaperonin结合一个Rubisco分子,但可以同时结合两个T4囊蛋白. 这种基质结合的差异表明GroEL中的每个基质引起的明显的构造变化.
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 分子生物学分子生物学
- 结构生物学 结构生物学
背景情况:
- 细菌的监护人GroEL对于蛋白质折叠至关重要.
- GroEL的功能涉及基板结合时的形状变化.
- 假设GroEL一次只结合一个基质.
研究的目的:
- 为了研究GroEL与不同基质的结合史泰基度.
- 要了解由基质结合引起的构造变化.
- 为了比较模型基质 (Rubisco) 和自然基质 (T4囊蛋白) 的结合行为.
主要方法:
- 电子喷射电离质谱仪 (ESI-MS). 电子喷射电离质谱仪.
- 在GroEL基底复合体上进行并列质谱 (MS/MS).
- 对基质结合固基度和复杂稳定性的分析.
主要成果:
- GroEL 结合了 Rubisco 的一个分子,这与之前的假设一致.
- GroEL可以同时结合T4囊蛋白的两个分子.
- 鲁比斯科结合显著稳定了GroEL复合体,而单囊蛋白结合则没有.
- 两个状蛋白质的结合使GroEL稳定,类似于一个Rubisco.
结论:
- 具有相似大小的基质可以诱导GroEL中的明显的形状变化.
- T4囊蛋白的结合不会显著改变GroEL转环,允许同时结合.
- GroEL的结合机制依赖于基质,影响其结构动态.


