在Streptomyces coelicolor中进行基因组挖掘:分子克隆和描述一种新的基合成酶
Xin Lin1, Russell Hopson, David E Cane
1Department of Chemistry, Brown University, Box H, Providence, Rhode Island 02912-9108, USA.
Journal of the American Chemical Society
|May 4, 2006
概括
这种菌种是Streptomyces coelicoloror.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 生物化学 生物化学
- 有机化学 有机化学
背景情况:
- 烯合成酶是自然产品生物合成中的关键酶.
- 斑点菌 (Streptomyces coelicolor) 是一种经过充分研究的细菌,具有丰富的代谢谱.
研究的目的:
- 来自Streptomyces coelicolor的新型烯合成酶SCO5222的特征.
- 为了阐明四烯 (+) -epi-isozizaene的结构和生物合成途径.
主要方法:
- 在大肠杆菌中基因克隆和蛋白质表达.
- 用法纳西二酸盐 (FPP) 进行酶分析.
- 使用先进的NMR技术进行结构阐明 (1H,13C,COSY,HMQC,HMBC,NOESY).
- 用脱的FPP类似物进行同位素标记研究.
主要成果:
- 再组合的SCO5222p从FPP中产生 (+) -epi-isozizaene.
- 完全确定了 (+) -epi-isozizaene 的结构和立体化学.
- 确定了FPP的运动参数 (kcat,Km).
- 提出了一种反应机制,涉及通过 (3R) - 尼罗利二酸盐进行异构化-循环化-重新排列.
结论:
- SCO5222编码了一种新型的酸合成酶.
- 该酶利用复杂的机制来形成基烯.
- 这项研究扩大了Streptomyces中已知的烯生物合成的多样性.


