模拟的展开状态组合和维林头饰的实验性NMR结构产生了类似的广角溶液X射线散射配置文件
Bojan Zagrovic1, Vijay S Pande
1Physical Chemistry Institute, ETH Zurich, 8093 Zurich, Switzerland. zagrovic@igc.phys.chem.ethz.ch
Journal of the American Chemical Society
|September 7, 2006
概括
解液X射线散射展开的多揭示了有限的二次结构信息. 模拟的未折叠头的广角散射模式类似于NMR结构的广角散射模式,这表明捕获的次要结构细节最小.
科学领域:
- 结构生物学 结构生物学
- 生物物理学的生物物理.
- 生物化学 生物化学
背景情况:
- 溶液X射线散射是确定多结构的强大技术,特别是使用先进的同步子源.
- 这种方法产生了一维数据,需要通过三维模型构建进行解释.
研究的目的:
- 为了研究未折叠的多结构的广角溶液散射模式的信息含量.
- 将模拟的展开状态的散射模式与来自本地结构的实验数据进行比较.
主要方法:
- 对模拟的未折叠维林头部结构组合的广角溶液散射模式的计算.
- 模拟参数包括与原生结构 (rmsd = 8.8 +/- 1.0 Å) 和最小二次结构的偏差.
主要成果:
- 模拟展开组合的计算散射模式与来自实验NMR结构的模式显著相似.
- 尽管在模拟组合中存在实质性的结构差异和缺乏本地二次结构,但仍观察到这种相似性.
结论:
- 仅仅是广角溶液散射就提供了关于多的二次结构含量的有限信息.
- 该技术在分析的结构状态中提供了对侧链包装的最小洞察力.
相关概念视频
Protein Folding
Overview
Electron Microscope Tomography and Single-particle Reconstruction
Transmission electron microscopy (TEM) can be used to determine the 3D structure of biological samples with the help of techniques such as electron microscope tomography and single-particle reconstruction. While single-particle reconstruction can examine macromolecules and macromolecular complexes in vitro conditions only, tomography permits the study of cell components or small cells in vivo.
Electron Tomography
Electron tomography can be performed either in TEM or STEM (scanning transmission...
Electron Tomography
Electron tomography can be performed either in TEM or STEM (scanning transmission...


