基于活性的探针的优化,用于基因素脱乙酶复合物的蛋白质分析
Cleo M Salisbury1, Benjamin F Cravatt
1The Skaggs Institute for Chemical Biology, 10550 North Torrey Pines Road, La Jolla, California 92037, USA.
Journal of the American Chemical Society
|January 26, 2008
概括
我们开发了一种可点击的新型探针SAHA-BPyne,用于跟踪活细胞中的基因组脱乙酶 (HDAC) 活性. 这种探测器优于现场分析,有助于癌症药物开发.
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
- 化学生物学 化学生物学
背景情况:
- 基因组脱乙酶 (HDACs) 是重要的表观遗传调节剂和潜在的抗癌标.
- 基于活动的探针是研究复杂生物系统中酶功能的宝贵工具.
研究的目的:
- 评估SAHA-BPyne和相关HDAC探针的选择性,敏感性和抑制潜力.
- 评估SAHA-BPyne对于在现场活细胞中HDAC活性概况的有用性.
- 为了证明在癌症研究中应用现场HDAC分析的应用.
主要方法:
- 开发和描述光反应"可点击"探针.
- 对HDAC抑制和复合体形成的评估.
- 在现场活细胞中基于活动的蛋白质概况.
- 在癌细胞中比较HDAC活性和表达.
主要成果:
- 与其他探针相比,SAHA-BPyne在活细胞中分析HDAC活动方面表现优异.
- 萨哈-BPyne的增强疗效归因于除了简单的HDAC结合功效之外的因素.
- 在现场分析显示了HDAC1活性和HDAC1表达的差异,这些差异发生在用帕瑟诺利德治疗的癌细胞中.
结论:
- SAHA-BPyne是HDAC活动现场分析的一个有价值的工具.
- 基于活动的蛋白质概况提供了关于细胞环境中的HDAC功能的见解.
- 基于化学的探针对研究各种酶活动充满希望.
