对2',3'-二化核酸的全面结构研究:理论,溶液和固态的比较
Joseph J Barchi1, Rajeshri G Karki, Marc C Nicklaus
1Laboratory of Medicinal Chemistry, National Cancer Institute, Frederick, National Institutes of Health, 376 Boyles Street, P.O. Box B, Frederick, Maryland 21702, USA. barchi@helix.nih.gov
Journal of the American Chemical Society
|June 19, 2008
概括
这项研究研究了原子如何影响核酸结构. 化物 化物 化物
科学领域:
- 药用化学 医学化学
- 有机化学 有机化学
- 计算化学的计算化学
背景情况:
- 核酸体构成对生物活动至关重要.
- 的替代可以显著改变核酸的特性.
- 了解在核酸结构中的作用是药物设计的关键.
研究的目的:
- 阐明邻近的原子对核酸中 furanose 环的构造性影响.
- 确定C2'和C3'原子在决定糖偏好的特定作用.
- 开发一种对核体构成的影响模型.
主要方法:
- 对于固态结构的确定,使用X射线晶体学.
- 核磁共振 (NMR) 光谱 (1H和19F) 用于溶液状态的结构分析.
- 从初始计算来推导构造参数和理论模型.
- 使用PSEUROT程序进行符合性分析.
主要成果:
- 在二化尿素核化物中确定了首选的糖.
- 证明左侧和反周平效应都会导致附近原子的伪二轴排列.
- 与固态结构和理论预测相关的溶液状态构造.
结论:
- 在C2'和C3'处的副原子显著影响着酸盐环.
- 为在调节核酸形状中的多方面的作用提出了一个模型.
- 这些发现为治疗应用的化核酸类型的设计提供了洞察力.
