多核核核磁共振和DNA跨链交叉链形成的动力分析
Hui Ding1, Ananya Majumdar, Joel R Tolman
1Department of Chemistry and Biomolecular NMR Center, Johns Hopkins University, 3400 North Charles Street, Baltimore, Maryland 21218, USA.
Journal of the American Chemical Society
|December 5, 2008
概括
通过基因和氧化途径,基基改性胺形成DNA链间交叉链 (ICLs). 这些机制产生相同的初始ICL产品,可以随着时间的推移重新排列.
科学领域:
- 化学生物学 化学生物学
- DNA损伤和修复的过程
- 有机化学 有机化学
背景情况:
- 已知一种修饰为基基胺的胺衍生物 (2) 可诱导DNA链间交叉链 (ICLs).
- 从这种衍生物中形成ICL的两种不同的机制已被提出,其中包括一个中间基 (1) 或一种氧化途径,产生一种类似于甲基的物种 (4).
研究的目的:
- 通过激素和氧化途径形成的初始DNA跨链交叉链接产品的最终确定.
- 阐明ICL形成和随后重新排列的反应机制和动力学.
主要方法:
- 基基基胺的光解和轻度氧化 (2).
- 动力竞争研究和与阿齐德的反应,以探测反应途径.
- 在现场使用核磁共振 (NMR) 分析合成的产品,双重标记的DNA复合体.
主要成果:
- 通过光解产生的中间基 (1),与相反的脱氧腺素 (dA) 反应形成ICL,代表了第一个涉及ICL形成的DNA基.
- 氧化途径,形成甲基类物种 (4),也通过S(N) 2'机制导致ICLs与对立的da.
- 现场核磁共振分析证实,这两种途径都产生相同的初始ICL产物,由N(1)-dA的化产生的.
- 最初形成的交叉链接通过DNA中的关联机制重新安排为热力学产物.
结论:
- 基基改性胺是通过不同的激素和氧化途径生成DNA跨链交叉链的多功能前体.
- 最初的ICL产品的身份在两个机制中都被保留,为进一步研究提供了一致的目标.
- 形成的DNA跨链交叉链接可以异构,突出显示DNA附带的动态性质以及它们在DNA环境中的重新排列潜力.
