通过针对性蛋白质组学对S. cerevisiae进行全动态范围蛋白质组分析
Paola Picotti1, Bernd Bodenmiller, Lukas N Mueller
1Institute of Molecular Systems Biology, ETH Zurich, Zurich CH 8093, Switzerland.
Cell
|August 12, 2009
概括
选择反应监测 (SRM) 蛋白质组学能够敏感地检测和量化酵母中少量蛋白质. 这种有针对性的方法超越了各种蛋白质度的高通量分析的经典方法.
科学领域:
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
- 系统生物学 系统生物学
- 生物化学 生物化学
背景情况:
- 系统生物学需要在多个样本中进行敏感,快速和一致的蛋白质检测和量化.
- 经典质谱和基于亲和力的方法部分满足了这些需求.
- 需要先进的技术来分析低丰度蛋白质.
研究的目的:
- 应用一个有针对性的蛋白质组学方法,使用选择反应监测 (SRM) 来检测和量化蛋白质.
- 评估SRM在Saccharomyces cerevisiae中以低于50个副本/细胞的度分析蛋白质的能力.
- 为了证明SRM对于高通量,蛋白质网络的定量测量的实用性.
主要方法:
- 利用基于选择反应监测 (SRM) 的向蛋白质组学.
- 分析了Saccharomyces cerevisiae的总消化物.
- 测量了整个生长过程中的蛋白质丰富度,涵盖了各种代谢阶段.
主要成果:
- 成功检测并量化了以低于50副本/细胞的度表达的蛋白质.
- 将检测范围扩展到单位拷贝/细胞,识别经典方法遗漏的蛋白质.
- 证明了对跨越整个丰富范围的蛋白质网络的一致和快速测量.
结论:
- 基于SRM的向蛋白质组学为检测和量化低丰度蛋白质提供了更高的灵敏度.
- 该技术为分析酵母中的蛋白质集提供了高通量和定量准确性.
- SRM蛋白质组学是系统生物学研究的强大工具,能够进行全面的蛋白质组分析.
