爱尔兰马饥荒病原体Phytophthora infestans的基因组序列和分析
Brian J Haas1, Sophien Kamoun, Michael C Zody
1Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, Massachusetts 02141, USA.
Nature
|September 11, 2009
概括
植物虫的基因组是最大的测序染色体基因组,揭示了效应基因的快速演变. 这种基因组复杂性解释了病原体的适应能力和对全球土豆作物的破坏性影响.
科学领域:
- * 基因组学和病原体进化
- *植物病理学和农业科学
背景情况:
- *Phytophthora infestans是一种具有破坏性的虫病原体,会导致马晚期腐烂,马是全球重要的粮食作物.
- * 这种病原体历史上导致了爱尔兰土豆饥荒,并继续造成重大经济损失 (每年67亿美元).
- *P. infestans表现出了显著的适应能力,与耐药品种一样具有挑战性的控制策略.
研究的目的:
- * 为了报告Phytophthora infestans的基因组序列.
- *分析P. infestans快速适应和进化潜力的基因组基础.
主要方法:
- * 全基因组测序Phytophthora infestans的. 这是一个很好的方法.
- *与其他Phytophthora物种进行基因组比较分析.
- *对效应蛋白基因家族的识别和表征.
主要成果:
- *对P. infestans的基因组进行了测序 (大约. 240 Mb),这是迄今为止最大和最复杂的染色体基因组.
- * 发现重复性DNA约占基因组的74%,有助于其扩展.
- * 确定了效应蛋白基因家族的快速转换和扩张,许多是在感染期间诱导并参与宿主操纵.
结论:
- * 庞大而复杂的P. infestans基因组,以广泛的重复DNA和扩大的效应基因家族为特征,是其快速适应性的基础.
- * 位于动态基因组区域的快速进化的效应基因是病原体进化成功和对农业的影响的关键.
