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Updated: Jun 8, 2026
07:50
Chromatin Immunoprecipitation of Murine Brown Adipose Tissue
Published on: November 21, 2018
对小鼠和人类脂肪生成的比较表观基因组分析
Tarjei S Mikkelsen1, Zhao Xu, Xiaolan Zhang
1Broad Institute, 7 Cambridge Center, Cambridge, MA 02142, USA.
Cell
|October 5, 2010
概括
这项研究在小鼠和人类的脂肪细胞发育过程中绘制了全基因组的染色质变化图,揭示了不同的调节元素,并确定了新的基因调节者. 这有助于我们对脂肪生成的理解.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
- 细胞分化 细胞分化
背景情况:
- 脂肪生成,脂肪细胞形成的过程,涉及复杂的基因调节.
- 了解驱动脂肪生成的表观遗传机制对于代谢研究至关重要.
研究的目的:
- 在小鼠和人类脂肪生成模型中生成和比较全基因组染色质状态图,转录因子结合概况和基因表达数据.
- 识别和描述参与前脂肪细胞和脂肪细胞分化中的cis-regulatory元素.
- 研究调控元素的进化动态,并确定脂肪生成的新型调节者.
主要方法:
- 生成全基因组染色体状态图 (例如,用于基因组修饰的ChIP-seq).
- PPARγ (氧酶增殖器激活受体马) 和CTCF (CCCTC-结合因子) 局部映射.
- 基因表达概况 (例如,RNA-seq).
- 序列分析和报告测试用于对调控元件和转录因子动机的功能验证.
- 使用染色体可访问性和动图分析识别转录因子 (例如PLZF,SRF).
主要成果:
- 在两种物种的脂肪生成过程中,染色质重塑的高分辨率地图.
- 数以千计的假定前脂肪细胞和脂肪细胞特异性cis调节元件的识别.
- 在小鼠模型和人类模型之间,监管元素的位置存在显著差异,即使是在保存的位置.
- 证明转录因子结合基因的进化周转是这些差异的驱动因素.
- 鉴定和验证PLZF (Promyelocytic Leukemia Zinc Finger) 和SRF (血清反应因子) 作为脂肪生成的新型调节剂.
结论:
- 染色体动态为脂肪生成提供了关键的见解.
- 在cis-regulatory元素的进化变化有助于物种特异性基因调节在脂肪生成.
- PLZF和SRF是脂生成过程的经过验证的调节者.
