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在特定与DNA结合时,GCN4的DNA结合域中的折叠过渡
M A Weiss1, T Ellenberger, C R Wobbe
1Department of Biological Chemistry and Molecular Pharmacology, Harvard Medical School, Boston, Massachusetts 02115.
Nature
|October 11, 1990
概括
酵母转录激活剂GCN4是酵母的转录激活剂.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 生物化学 生物化学
- 结构生物学 结构生物学
背景情况:
- 蛋白质-DNA识别经常涉及结构图案,如螺旋转螺旋或指.
- 转录因子利用诸如leucine-zipper和DNA结合的基本区域等动机.
- 酵母转录激活剂GCN4属于保存的真核转录因子家族.
研究的目的:
- 研究GCN4DNA结合域 (GCN4-p) 的结构性质.
- 阐明基底区域在DNA结合和结构转换中的作用.
- 了解GCN4-p如何与不同的DNA结合部位相互作用.
主要方法:
- 循环二重化谱法用于评估α-螺旋内容.
- 质子核磁共振 (1H-NMR) 谱学用于结构分析.
- 用不同度的GCN4-p和在特定DNA序列的存在下进行的研究.
主要成果:
- GCN4-p表现出度依赖的α-螺旋过渡,表明二元化.
- 在25°C时,GCN4-p二元体大约70%是螺旋形,基本区域基本上是无结构的.
- 对GCN4-p的DNA结合显著增加了至少95%的α-螺旋体含量,稳定了基本区域.
结论:
- GCN4-p的基本区域在生理温度下展开,并在DNA结合时采用稳定的α-螺旋形状.
- 这种折叠过渡对于调解特定的蛋白质-DNA相互作用至关重要.
- GCN4-p在适应不同长度的DNA点点方面表现出灵活性.