一个有条件的淘汰赛资源,用于对小鼠基因功能的全基因组研究.
William C Skarnes1, Barry Rosen, Anthony P West
1Wellcome Trust Sanger Institute, Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton, Cambridge CB10 1SA, UK. skarnes@sanger.ac.uk
Nature
|June 17, 2011
概括
研究人员开发了一种高通量管道,用于在小鼠胚胎干细胞中创建记者标记的条件基因等位基因. 这种可扩展的方法加速了针对性突变的生成,以了解哺乳动物之间的基因功能.
科学领域:
- 基因组学和分子生物学
- 哺乳动物遗传学 哺乳动物遗传学
- 干细胞生物学 干细胞生物学
背景情况:
- 胚胎干细胞中的基因向对于小鼠基因组操纵和条件突变发生至关重要.
- 大规模的淘汰计划旨在为所有蛋白质编码基因创建针对性突变的全面资源.
- 现有的方法需要优化,以高通量生成多样化的等位基因.
研究的目的:
- 建立一个高通量基因向管道,用于生成记者标记的条件等位基因.
- 为更广泛的研究社区扩大针对性突变的生产规模.
- 为全基因组努力破译哺乳动物基因功能奠定基础.
主要方法:
- 开发一个高吞吐量管道,整合计算等位基因的设计.
- 使用96井模块化矢量结构,用于高效的等位基因生成.
- 采用高效的基因向策略,在具有生殖线能力的C57BL/6N胚胎干细胞中.
主要成果:
- 成功建立了一个可扩展的基因向管道.
- 产生了超过12,000个载体和9,000个条件向基因.
- 展示高通量基因组工程能力的演示.
结论:
- 开发的管道使得在生成条件向等位基因方面实现了前所未有的规模.
- 这种高通量基因组工程方法适用于老鼠和人类的干细胞.
- 该资源促进了未来的全基因组研究,以确定所有哺乳动物基因的功能.
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