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有证据表明,C/EBP对DNA结合的蛋白酶敏感性和亚单元交换率发生了变化
J D Shuman1, C R Vinson, S L McKnight
1Howard Hughes Research Laboratories, Department of Embryology, Baltimore, MD 21210.
概括
转录因子C/EBP在DNA结合时经历了显著的构造变化,由蛋白酶敏感性证明. 这些变化支持了DNA结合的"剪刀抓"模型.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 结构生物学 结构生物学
- 生物化学 生物化学
背景情况:
- 转录因子C/EBP (CCAAT/增强剂结合蛋白) 使用双重结构图案来结合DNA.
- 这种图案涉及通过氨酸拉链进行二元化和通过基本区域进行DNA相互作用.
研究的目的:
- 为了研究C/EBP在DNA结合过程中的构造变化.
- 为了验证C/EBP-DNA相互作用的拟议的"剪刀抓"模型.
主要方法:
- 用蛋白酶消化试验来评估C/EBP在无体和DNA结合状态中的构造状态.
- 蛋白质分解片段的测序确定了特定的裂变部位.
主要成果:
- 无联体C/EBP的基本区域对蛋白酶消化非常敏感.
- 与其特定的DNA基质结合的C/EBP表现出对蛋白质分解的抗性增加.
- 蛋白解裂部位映射到"剪刀抓"模型预测的十字路口,包括leucine拉链-基本区域接口和促进DNA跟踪的非螺旋段.
结论:
- 这项研究提供了实验证据,支持C/EBPDNA结合的"剪刀抓"模型.
- 在DNA关联时,C/EBP发生了显著的构造变化,特别是在基础区域及其结点.