作为蛋白质氨酸脱乙基化和脱甲基化探针的阿扎利辛类似物

科学领域:

• 生物化学 生物化学
• 分子生物学分子生物学
• 化学生物学 化学生物学

背景情况:

• 氨酸乙化和甲基化是调节蛋白质功能,特别是基因素的关键可逆后翻译性修改.
• 基因组脱甲基酶 (HDAC) 和基因组脱甲基酶是参与这些调节过程的关键酶.
• 开发特定的化学探针对于理解这些酶的机制至关重要.

研究的目的:

• 合成和表征含阿扎利辛的类作为基因素脱乙酶 (HDAC8,Sir2Tm,SIRT1) 和基因素脱甲酶LSD的化学探针1.1.
• 为了研究乙-阿扎利辛对Sirtuins和HDAC8.8的基质效率.
• 在LSD1.1.上探索非乙化阿扎利辛的抑制机制.

主要方法:

• 含有阿扎利辛的乙化和未乙化的合成.
• 使用纯化的HDAC8,Sir2Tm,SIRT1和LSD1.1.进行酶分析.
• 使用质谱学,西方斑点分析和核磁共振 (NMR) 光谱学对反应产物的表征.

主要成果:

• 乙-亚氨酸作为Sirtuins的高效基质,但HDAC8.8的较弱基质.
• 通过Sirtuin介导的乙-亚氨酸脱乙化产生了一种新的ADP-ribose添加物,这表明反应中介物脱轨了.
• 非乙化阿扎利辛H3作为LSD1的强有力的抑制剂,形成一个特有的FAD添加物.

结论:

• 基于阿扎利辛的酸是研究基因组修饰酶的有价值的化学探针.
• 新的ADP-ribose添加物为Sirtuin催化脱乙烯化提供了机理性的洞察力.
• 阿扎利辛H3抑制剂为研究LSD1脱甲基酶机制提供了一个新的工具.