实验和理论评估多位卡的交换 (II) 设计的三链卷-卷的
Saumen Chakraborty1, Olga Iranzo, Erik R P Zuiderweg
1Department of Chemistry, University of Michigan, University of Michigan Medical School, Ann Arbor, Michigan 48109, USA.
Journal of the American Chemical Society
|March 8, 2012
概括
设计中的 (II) 离子交换动态揭示了多位点结合模型. 过多的与表面残留物结合会破坏螺旋结构的稳定,影响主要结合点.
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 化学生物学 化学生物学
- 结构生物学 结构生物学
背景情况:
- 金属离子交换动态对于理解重金属如对生物宏分子的毒性至关重要.
- 金属离子交换成蛋白质的基本速率和机制,特别是螺旋捆,仍然不太了解.
研究的目的:
- 通过使用新设计的三链卷轴来研究 (Cd) 的交换动力学.
- 为了建模Cd(II) 加入到三元体,并行卷轴卷轴中,使用具有工程氨酸酸盐金属结合位点的.
主要方法:
- 设计和合成具有单个和双个Cd (II) 结合位点的de novo卷轴-卷轴.
- 证实了高亲和度Cd (II) 的结合 (K (A) > 3 × 10 (7) M (-1)).
- 使用 (113) 核磁共振 (NMR) 光谱学监测Cd的结合,在过多Cd的定位过程中进行Cd的结合.
主要成果:
- Cd(II) 绑定发生在极其缓慢的交换制度中.
- 过度的Cd(II) 定位导致线路逐渐扩大,并且显著地导致信号消失,与简单的两站交换不一致.
- 一个多站点结合模型,包括额外的表面结合点,准确地模拟了观察到的NMR数据,解释了信号损失.
结论:
- 在螺旋式接口处过多的Cd(II) 结合到表面的谷氨酸 (Glu) 残留物可能会破坏卷轴结构的稳定.
- 这种不稳定扰乱了主要的Cd(II) 结合部位,导致观察到的NMR信号变化.
- 表面Glu残留物可以作为Cd(II的入口点,促进其进入内部结合点,并提供对生物系统中的金属复合的见解.
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