使用简单的化学传感器阵列阅读基因组代码的无抗体阅读.

科学领域:

• 生物化学 生物化学
• 化学生物学 化学生物学
• 分子生物学分子生物学

背景情况:

• 基因组代码,一个基因组翻译后修改的网络,调节基因表达,并与许多人类疾病有关.
• 精确检测特定的组素修饰对于了解疾病机制至关重要.

研究的目的:

• 开发一种多用途的染色体位移传感器工具包,用于检测阴离子,特别是基质子修饰.
• 为了证明由这些传感器组成的化学传感器阵列能够强有力的区分各种组素代码元素的能力.

主要方法:

• 一种混合与匹配的方法,它结合了随时可用的染料和色素宿主分子,以创建染料位移传感器.
• 使用一个由两个或三个超分子传感器组成的化学传感器阵列来生成数据指纹,用于组织蛋白修饰分析.
• 采用传感器阵列来识别不同的修改,修改组合和基因组尾的序列上下文.

主要成果:

• 传感器阵列成功地区分了非甲基化,单基,二基和三基甲基化氨酸在基因素尾巴上的区别.
• 该系统在单基因尾序列和不同的序列环境中识别了各种修饰类型和组合.
• 还确定了异构二甲基氨酸的修饰,克服了基于抗体的方法所面临的局限性.
• 该阵列同时报告了基因组修饰的度和身份.

结论:

• 一个新的超分子传感器工具包,使得能够对多样化的基因组编码元素进行强大的区分.
• 这种传感器阵列提供了一个强大而通用的平台,用于分析基质子的修改,包括具有挑战性的目标.
• 同时确定度和身份的能力推动了对表观遗传调节和相关疾病的研究.