在增殖和静止细胞中对裂变酵母转录和蛋白质的定量分析
Samuel Marguerat1, Alexander Schmidt, Sandra Codlin
1University College London, Department of Genetics, Evolution and Environment and UCL Cancer Institute, London WC1E 6BT, UK.
Cell
|October 30, 2012
概括
这项研究量化了裂变酵母中所有RNA和大多数蛋白质度,揭示了细胞数量如何在增殖和静止期间发生变化. 这为了解细胞调节和生物系统提供了定量资源.
科学领域:
- 定量生物学的定量生物学.
- 细胞和分子生物学是细胞和分子生物学.
- 系统生物学 系统生物学
背景情况:
- 了解绝对分子数量对于建模细胞功能至关重要.
- 之前的研究缺乏全面量化RNA和蛋白质度在真核细胞.
- 分裂酵母作为研究基本生物过程的模型生物.
研究的目的:
- 为核分裂酵母中绝对RNA和蛋白质度提供全面的参考.
- 为了比较细胞增殖和静止期间的分子水平.
- 为了获得关于细胞调节和定量生物学的见解.
主要方法:
- 转录组和蛋白质组的定量测量.
- 在增殖和静止条件下对裂变酵母进行分析.
- 整合RNA和蛋白质度数据.
主要成果:
- 在真核生物中建立了RNA和蛋白质度的第一个全面参考.
- 证明大多数较长的非编码RNA被压抑到1副本/细胞以下,与mRNA不同.
- 显示的蛋白质比mRNAs更加丰富和动态,在静止期间随细胞体积扩大.
结论:
- 综合数据集支持定量生物学,并提供有关细胞调节的见解.
- 细胞循环转录动态调节mRNA数量,使开关式表达成为可能.
- 蛋白质度由功能需求和细胞体积的尺度来调节,与mRNA不同.
更多相关视频
12:57Genome-wide Quantification of Translation in Budding Yeast by Ribosome Profiling
Published on: December 21, 2017
11.1K
09:21Saccharomyces cerevisiae Metabolic Labeling with 4-thiouracil and the Quantification of Newly Synthesized mRNA As a Proxy for RNA Polymerase II Activity
Published on: October 22, 2018
8.6K
