西斯普拉丁与腺素和关氨酸的相互作用:IRMPD,MS/MS和理论研究的综合研究
Barbara Chiavarino1, Maria Elisa Crestoni, Simonetta Fornarini
1Dipartimento di Chimica e Tecnologie del Farmaco, Università di Roma La Sapienza, P.le A. Moro 5, I-00185 Roma, Italy. barbara.chiavarino@uniroma1.it
Journal of the American Chemical Society
|January 1, 2013
概括
红外光谱显示,西斯在N7原子与瓜宁结合,形成键. 氨酸-氨酸复合物存在于两个主要异构体,在N3和N1位置结合.
科学领域:
- 协调化学 协调化学
- 频谱学是一种光谱学.
- 计算化学是一种计算化学.
背景情况:
- 西斯普拉丁是一种重要的化疗药物.
- 了解它与DNA基的相互作用对于药物开发至关重要.
- 光谱和计算方法是阐明分子结构的关键.
研究的目的:
- 通过IRMPD光谱学来描述西斯丁与关氨酸和腺氨酸的结合方式.
- 确定这些复合物的特定附着点和结构构造.
- 用实验光谱数据验证计算模型.
主要方法:
- 红外多光子解离 (IRMPD) 光谱在950-1900厘米 (-1) 和2900-3700厘米 (-1) 区域.
- 量子化学计算 (B3LYP/LACV3P/6-311G**) 用于几何优化和红外光谱预测.
- 分析特征性振动频率,包括C=O拉伸,以确定结合和相互作用.
主要成果:
- 对于cis-[Pt(NH3) 2 ((G) Cl]+来说,IRMPD和计算证实了Pt与瓜N7原子的结合.
- 在NH3联体和关氨酸的碳基组之间确定了一种键,由在1718厘米的红移C=O延伸证明.
- 对于cis-[Pt(NH3) 2 ((A) Cl]+的IRMPD光谱显示了两个主要异构体:Pt与腺因的N3 (PtAN3) 和N1 (PtAN1) 位置结合.
结论:
- 西斯丁通过N7原子首选与关氨酸结合,其中涉及NH3连接体和关氨酸的碳氧的显著键相互作用.
- 与腺因的相互作用导致两种不同的异构体,PtAN3和PtAN1,突出显示了西斯与DNA基的复杂结合偏好.
