回收尼古丁胺胺的使用. 人类尼古丁胺胺酸基转移酶的过渡状态结构
Emmanuel S Burgos1, Mathew J Vetticatt, Vern L Schramm
1Department of Biochemistry, Albert Einstein College of Medicine, 1300 Morris Park Avenue, Bronx, New York 10461, United States.
人类NAMPT酶的人类NAMPT酶
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 酶学 是一种酶学.
- 结构生物学 结构生物学
背景情况:
- 人类尼古丁胺胺酸转移酶 (NAMPT) 对于补充NAD+水平至关重要,影响由sirtuins和PARPs调节的细胞过程.
- 了解酶过渡状态 (TS) 是阐明NAMPT的催化机制和功能的关键.
研究的目的:
- 为了确定由人类NAMPT催化的热溶解反应的过渡状态 (TS) 结构.
- 使用实验性动态同位素效应和量子计算分析的组合,阐明反应机制.
主要方法:
- 使用同位素标记的尼古丁胺胺单核酸 (NMN) 和酸盐 (PPi) 来测量动态同位素效应 (KIEs).
- 量子化学计算包括催化场残留物,金属离子和水分子来建模TS.
- 分析在TS的反应坐标和键距离/角度.
主要成果:
- 确定了 [1'-(14) C], [1-(15) N, [1'-(3) H] 和 [2'-(3) H] 的实验KIEs.
- 量子力学计算准确地预测了实验KIE,支持一个拟议的TS模型.
- 该TS表现出显著的 ribocation 特性,具有弱相互作用的 pyrophosphate 核和延长的 N-ribosidic 键.
结论:
- 该研究定义了NAMPT催化NMN热溶解的反应坐标.
- 过渡状态结构与一个A(N) D(N) 机制相一致,涉及C1'-anomeric迁移.
- 酶的活性部位通过定位基质来稳定TS,以促进反应.
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