一个高分辨率的增强器地图集的发展的telencephalon
Axel Visel1, Leila Taher, Hani Girgis
1Genomics Division, MS 84-171, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA 94720, USA. avisel@lbl.gov
Cell
|February 5, 2013
概括
研究人员创建了一个在哺乳动物telencephalon发展过程中活跃的基因增强剂的数字地图. 该资源绘制了关键的调节元素,有助于研究大脑发育和神经发育障碍.
科学领域:
- 神经科学是一个神经科学.
- 发展生物学 发展生物学
- 遗传学 是一个遗传学.
背景情况:
- 哺乳动物的telencephalon对于复杂的认知,运动和情绪功能至关重要.
- 虽然已知多头脑发育的基因,但它们的调节序列在很大程度上没有表征.
- 了解基因调节是解读大脑发育和疾病的关键.
研究的目的:
- 创建一个全面的数字地图书的体内增强剂在发展中telencephalon.
- 识别和描述控制胚胎前脑基因表达的新型调节元件.
- 为研究神经发育中的基因调节提供资源.
主要方法:
- 识别了超过4,600种胚胎前脑增强剂的候选物质.
- 在转基因小鼠胚胎中对329种增强剂的体内验证.
- 为145个增强剂生成超过32,000个组织学脑部部分,创建基于网络的数据收集.
- 人类和小鼠皮质对全基因组增强器架构进行比较表观基因组学分析.
主要成果:
- 建立了一个活体增强剂在特定的telencephalon亚区域活跃的数字地图.
- 经过验证的增强剂为前脑发育期间的基因表达控制提供了洞察力.
- 对比分析显示,人类和小鼠皮层之间的增强器架构保持和分化.
- 创建了一个公开可访问的数据库,包含超过32,000个大脑部分.
结论:
- 数字地图表是理解电脑脑发育的基础资源.
- 这些发现促进了对基因调节机制的研究,这些基因调节机制是大脑形成的基础.
- 这些数据支持对神经发育障碍中增强剂作用的调查.


