设计和合成具有基米托里普辛类雌激酶活性的

科学领域:

• 生物化学 生物化学
• 化学生物学 化学生物学
• 蛋白质设计 蛋白质设计

背景情况:

• 酶活性部位对于催化功能至关重要.
• 用合成来模仿天然酶是生物仿真化学的一个重大挑战.

研究的目的:

• 设计和合成一个可模拟蛋白酶基莫特素 (ChTr) 的结构和功能的催化剂.
• 为了研究设计的的催化活性和基质特异性.

主要方法:

• 通过计算机建模,设计了一种四螺旋捆,其中包含了基米的催化三元组 (氨酸,氨酸,氨酸).
• 该被合成具有特定的结构特征,以模仿氧离子孔和基质结合口袋.
• 酶动力学和抑制试验是使用化学二基质和抑制剂进行的.

主要成果:

• 设计的可以证明它与基托里素基质有亲和力.
• 酸在基米的约1%速度下化基质,观察到的回转率超过100.
• 该被基米特异性抑制剂抑制,并没有对素基质表现出活性.
• 该在60°C以上被热失活,但在冷却和冷后恢复活性.

结论:

• 一个新设计的捆可以有效地模仿催化活性和基质特异性的自然酶,如 chymotrypsin.
• 这项工作展示了计算设计在创造功能生物模拟催化剂方面的潜力.