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在一组I内子的催化核中的3'拼接点结合序列
J M Burke1, J S Esherick, W R Burfeind
1Department of Microbiology and Molecular Genetics, University of Vermont, Burlington 05405.
Nature
|March 1, 1990
概括
组I的内子,对于RNA催化必不可少,通过特定的RNA-RNA相互作用与基质结合. 这项研究确定了Tetrahymena核糖体RNA内部核中的关键结合部位 (P9.0),这对于自剪接过程中的外链结合至关重要.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 生物化学 生物化学
- 遗传学 是一个遗传学.
背景情况:
- ribozymes,催化性RNA分子,依赖于精确的RNA-RNA相互作用来结合基质和形成活性位点.
- 第I组内子具有保护的催化核心,对于自剪接至关重要,需要与瓜诺辛和剪接部位等基质相互作用.
- 虽然对关素的结合有部分了解,但内核和结合部位之间的相互作用在很大程度上仍未被描述.
研究的目的:
- 为了研究在I组内核的催化核内拟议的RNA-RNA相互作用,I组内核负责结合3'拼接位.
- 为了基因验证这个假定结合部位的存在和功能意义,在Tetrahymena大亚单元核糖体RNA内部.
主要方法:
- 进行比较序列分析以假设潜在的结合部位.
- 基因操纵 (变异) 的Tetrahymena大亚单元核糖体RNA内核内核.
- 评估突变对自剪接反应的功能影响,特别是外链结合阶段.
主要成果:
- 遗传证据证实了内核内有一个特定的基配对相互作用 (称为P9.0) 的存在.
- 在自我拼接的外链结合步骤中,P9.0相互作用在功能上很重要.
- 而P9.0相互作用本身并不仅仅决定3'拼接位点的选择.
结论:
- 一种新的RNA-RNA相互作用,P9.0,已在I组内的催化核中被识别和验证.
- 这种相互作用在自我拼接过程中促进外链结合起着至关重要的作用.
- 虽然P9.0很重要,但它并不是3'拼接部位识别的唯一决定因素,这表明了更复杂的机制.