灵长类动物中重复性DNA序列的L1家族可能来自编码反转录酶相关蛋白质的序列

科学领域:

• 基因组学就是基因组学.
• 分子生物学分子生物学
• 进化生物学 进化生物学

背景情况:

• 灵长类动物和动物的基因组包含重复的L1家族 (LINE-1) 序列.
• L1元素表现出一种RNA介导的分散机制的特征.
• 之前的模型不能完全解释L1元素的高拷贝数.

研究的目的:

• 为了研究L1家族序列的进化保存.
• 为了确定L1家族内潜在的功能元素,负责其分散.
• 了解L1元素高扩散背后的机制.

主要方法:

• 从进化上遥远的物种中对L1家族序列进行比较分析.
• 在L1序列内对开放式读取框架 (ORF) 的生物信息分析.
• 对已知的聚合酶进行序列同质性搜索.

主要成果:

• L1家族序列包含一个ORF与RNA依赖的DNA聚合酶具有显著的同质性.
• 这种同质性延伸到病毒和可移植元素的起源.
• 有证据表明,在L1原始体内,一种保存的,潜在的酶性功能存在.

结论:

• L1家族很可能具有促进其活跃分散的内在功能.
• 这一功能可能涉及RNA依赖的DNA聚合酶活性.
• 比较基因组学支持L1增殖的进化保存机制.