高分辨率绘制显示了酵母半溶性中保存的,广泛的,动态的mRNA甲基化程序
Schraga Schwartz1, Sudeep D Agarwala, Maxwell R Mumbach
1Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA 02142, USA.
Cell
|November 26, 2013
概括
这项研究绘制了酵母化中的N(6) - 甲基氨酸 (m(6) A) 位点的地图,揭示了动态调节和保护. 这些发现提供了关于在这个关键的发育过程中的表皮转录组调节的见解.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 遗传学 是一个遗传学.
- 史诗转录组学 史诗转录组学
背景情况:
- 甲基氨酸 (m(6) 是最丰富的mRNA修饰.
- 它的精确基因组位置,时间动态和调节机制在很大程度上是未知的.
研究的目的:
- 在介质酵母转录中生成m(6) A位点的高分辨率基因组图.
- 为了研究时间动力学和调节m(6) 一种在半变化过程中的修饰.
- 开发一个预测模型,用于m(6) A网站.
主要方法:
- 介质酵母中单核酸分辨率的m(6)A位点的基因组映射.
- 对已识别的甲基化位点进行直接遗传验证.
- 生物信息建模用于从序列中预测m(6) A位点.
- 在一个介质的时间过程中分析了多个介质的形状.
主要成果:
- 在1,183个酵母转录中确定了1,308个假设的m(6) A位点.
- 从基因上验证了八个测试中的八个甲基化位点.
- 在相关物种中证明了m(6) A地点的显著保护.
- 开发了一个用于m(6)A站点识别的预测模型.
- 在变过程中观察到m(6) A轮的动态变化.
- 显示了与介质电路相关的 m(6) A 位点的本地和全球调节.
- 发现了m(6)A甲基转移酶复合体对于mRNA甲基化至关重要的核定位.
结论:
- 照明了一种保存和动态调节的m(6) 在酵母半转化中的甲基化程序.
- 提供了一种有价值的资源,用于研究m(6) 一种表体转录组修饰的功能.
- 强调了核细胞局部化对于mRNA甲基化的重要性.
