单分子计数方法:将离子吸收与DNA毛针折叠联系起来
Andrew Dittmore1, Jonathan Landy, Adrian A Molzon
1Materials Department and ‡BMSE Program, University of California , Santa Barbara, California 93106, United States.
Journal of the American Chemical Society
|April 4, 2014
概括
这项研究测量了在构造变化期间单个生物分子上的联结体变化. 研究人员发现,DNA展开以一种新的,非单调的方式释放 counterions,这取决于盐度.
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 生物物理学的生物物理.
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 干结合对于稳定生物分子构造至关重要.
- 了解形状变化期间的连接体动力学是生物化学过程的关键.
研究的目的:
- 开发和演示一种方法来测量在构造转换过程中单个生物分子上的连接体数变化.
- 为了研究在强力诱导的展开过程中DNA发针的离子大气层的变化.
主要方法:
- 结合热力学理论与单分子测量.
- 直接追踪的生物分子构造和相关的连接体数.
- 采用了一种强力不稳定的折叠过渡模型,用于DNA发针.
主要成果:
- 成功测量了连接物与单个,拉伸的生物分子进行构造变化的关联的变化.
- 确定在DNA展开过程中对子离子的释放是单价盐度的非单调函数.
- 观察到的现象与现有的核酸模型的预测相矛盾.
结论:
- 开发的连接体计数方法可以测量以前未观察到的现象.
- DNA的离子大气层比常见模型预测的要复杂得多,尤其是在展开过程中.
- 这种技术为联体-生物分子相互作用和构造动态提供了新的见解.
