基于rRNA序列的遗传学分析支持古细菌树,而不是eocyte树

科学领域:

• 分子进化分子进化
• 人类遗传学 是一个学科.
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 关于生命的原始血统及其进化关系的基本问题仍然受到高度辩论.
• 存在两个突出的模型:"古细菌树" (古细菌,Eubacteria,Eukaryotes) 和"eocyte树" (对eocytes与eukaryotes进行分组).
• 以往对细胞树的支持源于使用进化节方法对小亚单元核糖体RNA (rRNA) 的分析.

研究的目的:

• 通过强大的遗传学方法重新评估生命的主要血统的进化关系.
• 在重建进化树时,比较不同类遗传学方法 (进化,邻相结合,最大) 的性能.
• 为了解决古细菌和细胞树模型之间的争议.

主要方法:

• 使用邻相连接和最大宽限度的方法分析小子单元核糖体RNA (rRNA) 基因序列.
• 计算机模拟以评估在恢复已知的进化树的类遗传学方法的可靠性.
• 使用邻近连接,最大共存和进化共存方法分析大型亚单元rRNA序列.

主要成果:

• 使用邻近连接和最大节方法对小子单元rRNA数据的分析强烈支持古细菌树.
• 计算机模拟显示,使用邻接和最大的古细菌和细胞树的恢复率很高 (>90%),但进化的恢复率很低.
• 通过这三种方法对大型亚单元rRNA序列的分析明确支持了古细菌树.

结论:

• 考古细菌树,提出考古细菌,欧细菌和真核生物作为主要血统,得到了当前的遗传学分析的强有力的支持.
• 进化节方法可能在重建深层进化分歧方面不那么可靠,相比邻相结合和最大节方法.
• 这项研究提供了强有力的证据,支持生命早期进化的特定模型.