海中的微生物. 在开放的海洋中,多种类的迪尔转录振荡在异构型细菌组合中发生
Elizabeth A Ottesen1, Curtis R Young2, Scott M Gifford2
1Department of Civil and Environmental Engineering, Massachusetts Institute of Technology, Cambridge, MA 02139, USA. Center for Microbial Oceanography: Research and Education (C-MORE), University of Hawaii, Honolulu, HI 96822, USA. Department of Microbiology, University of Georgia, Athens, GA 30602, USA.
海洋细菌每天表现出基因表达周期,显示出协调的,特定于种群的节奏. 异质微生物中的这些透气循环会影响海洋生态系统和营养循环.
科学领域:
- 海洋微生物学 海洋微生物学
- 分子生态学分子生态学
- 海洋学 海洋学 海洋学
背景情况:
- 基因转录,新陈代谢和行为中的日间振荡在整个生命中都是常见的.
- 自然存在的海洋异质型细菌和古生物中的Diel循环是鲜为人知的.
研究的目的:
- 为了研究自然存在的海洋细菌群体中的 diel 基因转录模式.
- 为了确定异性质细菌浮游生物是否表现出基因表达的日常节奏.
主要方法:
- 海洋细菌种群的时间解析,全基因组转录组概况.
- 在3天的时间内在现场采样.
- 在蓝藻细菌和异质型细菌中分析基因表达周期性.
主要成果:
- 菌转录组显示了预期的 diel 周期性.
- 多个异性质细菌浮游生物群体出乎意料地在基因转录中显示出显著的 diel 循环.
- 不同的异质组表现出各种代谢基因的峰值转录表达的特定人群时间.
结论:
- 迪尔基因转录周期在海洋异质型细菌中很普遍,而不仅仅是自营型细菌.
- 多个物种分层的迪尔基因表达波可能调节海洋的生态化学过程.
- 这项研究揭示了海洋微生物群落中新型的透气调节层.
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