KINATEST-ID:一个开发酸化依赖的 terbium 敏感化激酶试验的管道
Andrew M Lipchik1, Minervo Perez, Scott Bolton
1Department of Medicinal Chemistry and Molecular Pharmacology, College of Pharmacy, Center for Cancer Research, Purdue University , West Lafayette, Indiana 47907.
Journal of the American Chemical Society
|February 18, 2015
概括
为非受体蛋白氨酸激酶 (NRTKs) 开发新的基质具有挑战性. 这项研究介绍了一个in silico管道,用于设计特定的,对兰化物敏感的基质,用于快速激酶选.
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 分子生物学分子生物学
- 药物发现 药物发现 药物发现
背景情况:
- 非受体蛋白氨酸激酶 (NRTK) 对细胞功能至关重要,是药物发现的关键标.
- 设计特定的基质以化为基础的激酶试验是困难的,因为NRTK之间的结构相似性和整合序列选择性与金属离子结合的挑战.
研究的目的:
- 开发一种可通用的in silico管道,用于设计依赖酸化的,对兰化物敏感的基质.
- 为了创建适合高通量选 (HTS) 应用的酶特异基质.
主要方法:
- 利用来自内源性激酶基质的精选蛋白质组数据和已知的 (Tb(3+)) 结合序列.
- 开发了用于生成,选,对齐和选择潜在基质的计算工具.
- 集成的序列选择性与金属离子结合特性Tb(3+) 敏感化.
主要成果:
- 成功设计了几种基质,在酶家族中表现出选择性.
- 在高通量选 (HTS) 应用中证明了开发的基板的实用性.
- 验证了in silico管道能够产生高效和特定的激酶试验的能力.
结论:
- 开发的in silico管道提供了一种策略,用于为几乎任何类型的氨酸激酶创建特定的基于兰他尼德的测试.
- 管道及其工具可以适应用于其他酶测定或识别蛋白质结合配体.
- 这种方法有助于快速和灵敏地选激酶活性,有助于药物发现工作.
