一个单一的氨基酸可以确定家庭主体蛋白质的DNA结合特异性

科学领域:

• 发育生物学是发展生物学.
• 分子遗传学分子遗传学
• 蛋白质-DNA相互作用

背景情况:

• 德罗斯菲拉的发育基因利用了homeobox编码的DNA结合域.
• 家庭主域与 prokaryotic 螺旋-转-螺旋图案共享同质性.
• 配对 (Prd) 蛋白质的DNA结合与Fushi tarazu (Ftz) 和Bicoid (Bcd) 不同.

研究的目的:

• 为了研究家庭主体-DNA相互作用.
• 确定螺旋转螺旋图案在DNA结合特异性中的作用.
• 阐明由家庭主体蛋白质进行序列识别的机制.

主要方法:

• 配对 (Prd) 家庭主体的螺旋-转-螺旋形状的位点导向突变发生.
• 对突变Prd蛋白的DNA结合特异性的分析.
• 与Fushi tarazu (Ftz) 和Bicoid (Bcd) 结合的Prd结合的比较.

主要成果:

• 在识别螺旋的C端单个氨基酸变化改变了Prd的DNA结合特异性.
• 这种单一突变使Ftz或BcdDNA结合特异性赋予了Prd.
• Prd表现出两种DNA结合活动,一种依赖于家庭主体,另一种独立于识别螺旋.

结论:

• 确定家庭主体特异性的氨基酸与 prokaryotic 蛋白质-DNA 接触残留物不同.
• 识别螺旋在家庭主体DNA序列特异性中起着至关重要的作用.
• 家庭主体蛋白质可以具有多种DNA结合活动.