交叉的转录网络限制了基因调控进化
Trevor R Sorrells1, Lauren N Booth1, Brian B Tuch2
11] Department of Biochemistry &Biophysics, Department of Microbiology &Immunology, University of California, San Francisco, California 94158, USA [2] Tetrad Graduate Program, University of California, San Francisco, California 94158, USA.
表观性,或基因相互作用,塑造了进化. 在酵母中,Ste12调节器进化出了独特的DNA结合,表明进化路径取决于网络上下文和先前的变化.
科学领域:
- 进化生物学是进化的生物学.
- 系统生物学 系统生物学
- 遗传学 是一个遗传学.
背景情况:
- 表观性 (非添加性遗传相互作用) 显著限制了进化轨迹.
- 表观症对生物网络,如转录电路的演变的影响仍然不太清楚.
研究的目的:
- 为了研究酵母转录网络的进化途径,调节交配费洛蒙反应.
- 了解表观如何影响转录因子DNA结合模式的演变.
主要方法:
- 祖先状态和进化中间体的重建.
- 对转录调节器Ste12结合机制的分析.
- 检查重叠的转录网络之间的相互作用.
主要成果:
- 转录调节器Ste12在不同的酵母血统中进化了两个不同的DNA结合模式.
- 通过Ste12直接结合DNA无法进入祖先状态.
- 直接结合的演变取决于细胞类型规范网络中先前的特定基因变异.
结论:
- 相互连接的生物网络中的位置限制了 cis-regulatory 区域的演变.
- 了解网络上下文对于预测进化路径和表现症的影响至关重要.
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