进行基因比较. 在人类和病毒基因组中系统地发现独立的翻译序列
Shira Weingarten-Gabbay1, Shani Elias-Kirma1, Ronit Nir1
1Department of Computer Science and Applied Mathematics, Weizmann Institute of Science, Rehovot 76100, Israel. Department of Molecular Cell Biology, Weizmann Institute of Science, Rehovot 76100, Israel.
研究人员在人类和病毒中发现了数千个控制基因翻译的新序列. 这揭示了转化调节机制的新见解以及基因的具体表达方式.
科学领域:
- 分子生物学
- 遗传学
- 病毒学
背景情况:
- 在包括翻译在内的多个层面上,基因表达受到严格监管.
- 独立于的翻译是控制蛋白质合成的关键机制,特别是在病毒和应激条件下.
- 了解转化控制是解读基因特异性和开发新疗法的关键.
研究的目的:
- 开发一种高吞吐量方法来量化上限独立的翻译.
- 在人类和病毒基因组中识别和描述新的独立转化元素.
- 阐明底层上限独立转换调节的机制.
主要方法:
- 开发一种高吞吐量双波测定方法,以测量无限度翻译效率.
- 生物信息分析以确定未翻译区域 (UTR) 和病毒多蛋白中的调节元素.
- 对已识别的调节元件及其与核糖体RNA的相互作用进行实验验证.
主要成果:
- 在人类和病毒基因组中发现了成千上万个新的独立转化序列.
- 在人类转录和病毒多蛋白区域的3' UTR中识别广泛的转化元素.
- 涉及RNA二次结构,短基因和与18S核糖体RNA (rRNA) 的基因配对的机制的表征.
结论:
- 在人类和病毒中,独立翻译是一种广泛的调节机制.
- 特定的序列元素及其与18S rRNA的相互作用对于独立于cap的翻译至关重要.
- 这项研究提供了翻译调节和潜在治疗点的全面地图.
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09:52An In Vitro Single-Molecule Imaging Assay for the Analysis of Cap-Dependent Translation Kinetics
Published on: September 15, 2020
13:07Determining 3'-Termini and Sequences of Nascent Single-Stranded Viral DNA Molecules during HIV-1 Reverse Transcription in Infected Cells
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