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染色体位置和进化速率变化在肠杆菌基因中的变化
P M Sharp1, D C Shields, K H Wolfe
1Department of Genetics, Trinity College, Dublin, Ireland.
Science (New York, N.Y.)
|November 10, 1989
概括
肠杆菌中的DNA进化速率在基因之间有所不同. 基因表达水平和接近复制原点 (oriC) 的基因表达水平影响突变率,远处的基因进化更快.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 分子生物学分子生物学
- 遗传学 是一个遗传学.
背景情况:
- 基因组内所有基因的DNA序列进化的速度并不均.
- 之前的研究表明,基因表达水平会影响进化速率,这是由于代使用偏差造成的.
研究的目的:
- 为了研究影响肠杆菌DNA序列演化的基数速率的因素.
- 确定基因表达,同义码子使用和DNA分歧上的染色体位置之间的关系.
主要方法:
- 对大肠杆菌和沙门氏菌之间的DNA序列进行比较分析. typhimurium.
- 专注于"沉默"的DNA部位,以尽量减少氨基酸变化的影响.
- 统计分析将基因分歧与基因表达水平和相对于 oriC 的染色体位置相关联.
主要成果:
- 在不同基因之间观察到DNA序列分歧的显著变化,即使在静音部位.
- 基因分歧与基因表达水平有很强的相关性,这表明选择是基于同义代码的使用.
- 对于表达约束较弱的基因,分歧也与染色体位置有关;远离oriC的基因显示出接近oriC的基因突变率的约两倍.
结论:
- 基因表达水平和染色体位置都会影响肠杆菌中的DNA序列演变.
- 靠近复制原点 (oriC) 似乎是突变速率变化的重要因素.
- 这些发现突出了选择性压力和区域基因组因素塑造细菌基因组进化的复杂相互作用.