通过替代拼接广泛扩大蛋白质相互作用能力
Xinping Yang1, Jasmin Coulombe-Huntington2, Shuli Kang3
1Genomic Analysis of Network Perturbations Center of Excellence in Genomic Science (CEGS), Dana-Farber Cancer Institute, Boston, MA 02215, USA; Center for Cancer Systems Biology (CCSB) and Department of Cancer Biology, Dana-Farber Cancer Institute, Boston, MA 02215, USA; Department of Genetics, Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA; Department of Obstetrics and Gynecology, Nanfang Hospital, Southern Medical University, Guangzhou 510515, China.
替代拼接可以产生多样化的蛋白质异型,它们可以作为不同的蛋白质,而不仅仅是变体. 这扩大了蛋白质组的功能复杂性,组织特异性相互作用推动了这些差异.
科学领域:
- 分子生物学
- 蛋白质组学
- 基因组学
背景情况:
- 替代拼接是已知的基因功能多样化的机制.
- 蛋白质异型对蛋白质组功能复杂性的全球影响在很大程度上未被描述.
研究的目的:
- 在蛋白质层级上系统地研究蛋白质异型的功能差异.
- 确定替代拼接是否显著扩大人类基因的功能复杂性.
主要方法:
- 克隆的全长开放的阅读框架的替代拼接的人类成绩单.
- 使用蛋白质-蛋白质相互作用分析来比较数百种蛋白质异形对.
- 分析了全球互动原子网络图中的同位体相互作用.
主要成果:
- 大多数蛋白质异形对的相互作用不到50%.
- 替代性异型的功能更像是不同的蛋白质,而不是小变体.
- 异形特异性相互作用伙伴通常表现出组织特异性表达,并属于不同的功能模块.
结论:
- 替代拼接显著扩大了蛋白质的相互作用能力.
- 许多替代的"异构体"在功能上是不同的,称为"功能性异构体".
- 这突显了蛋白质层面的功能复杂性的主要来源.
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