肠道微生物组变异的种群层面分析
Gwen Falony1, Marie Joossens2, Sara Vieira-Silva1
1KU Leuven-University of Leuven, Department of Microbiology and Immunology, Leuven, Belgium. VIB, Center for the Biology of Disease, Leuven, Belgium.
健康的肠道微生物组组成受到各种因素的影响,便的一致性和药物具有重大影响. 早期的事件似乎没有影响成年肠道微生物群.
科学领域:
- 微生物学
- 人体肠道微生物组研究
- 人口健康研究
背景情况:
- 平均健康人群的便微生物组的变化还不清楚.
- 之前的研究没有广泛研究影响大群健康肠道微生物组成的因素.
研究的目的:
- 用两个独立的队列分析健康个体的便微生物组变异.
- 确定与肠道微生物组成相关的因素,并对数据集中的发现进行验证.
- 了解宿主共变量与微生物组成之间的关系.
主要方法:
- 分析了两个大型的表型群:比利时的佛兰德肠道植物项目 (FGFP) 和荷兰的LifeLines-DEEP (LLDeep) 研究.
- 整合数据与全球微生物组数据集进行综合分析 (N=3948).
- 统计分析以确定69个临床和基于问卷的共变量和微生物群组成之间的关联.
主要成果:
- 鉴定出了14个属的核心微生物群,尽管肠道的全部多样性仍未得到充分探索.
- 69个宿主共变体与微生物群的变异有关,在队列中复制率为92%.
- 便的一致性具有最大的影响,而药物解释了最大的差异,并与其他关联相互作用.
- 像出生方式这样的早期事件并没有显著影响成年微生物群的组成.
结论:
- 宿主因素,特别是便的一致性和药物,显著影响健康个体的肠道微生物组合.
- 主体共变量与微生物组成之间的相关性表明,需要在未来的研究设计中纳入这些因素.
- 虽然存在核心微生物群,但仍存在显著的个体间变异,这表明需要进一步探索肠道多样性.
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