通过改善Streptomyces的功能转基因组学发现天然产品
Hala A Iqbal1, Lila Low-Beinart1, Joseph U Obiajulu1
1Laboratory of Genetically Encoded Small Molecules, The Rockefeller University , 1230 York Avenue, New York, New York 10065, United States.
Journal of the American Chemical Society
|July 23, 2016
概括
研究人员开发了新的功能性基因组选方法,以从无法培养的细菌中发现新的自然产品. 他们使用优化的Streptomyces表达系统识别了metatricycloene,一种独特的聚烯化合物.
科学领域:
- 微生物学
- 自然产品的发现
- 基因组学
背景情况:
- 由于培养环境细菌的困难,许多细菌的二次代谢物是无法获得的.
- 功能转基因组学提供了一种强大的方法来发现来自不同微生物群体的新生物活性化合物.
研究的目的:
- 确定生物合成基因群的异构表达的最佳Streptomyces宿主.
- 为构建高质量的元基因组图书馆开发改进的方法.
- 通过功能性基因组选发现新型天然产品.
主要方法:
- 选各种Streptomyces物种的天生的异质表达能力.
- 在选定的Streptomyces宿主中优化元基因学宇宙体库结构.
- 在Streptomyces albus中建立和选一个大规模的基因组图书馆.
主要成果:
- 确定 *Streptomyces albus* 为异构基因群表达的优质宿主.
- 建立了一个拥有150万个成员的元基因组图书馆.
- 发现了一种新型三环聚天然产品 - - 甲三环聚 (1).
- 标志着独特的减少性,代性多基因类基因集群编码甲基环.
结论:
- 在*Streptomyces albus*中进行了优化的功能转基因查,使得新代谢物的发现成为可能.
- 甲基环是一种新的聚化合物,有进一步探索的潜力.
- 基因组分析表明,由相关的基因集群编码的多基代谢物有着庞大的,尚未探索的库存.
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