通过固态NMR和分子动力学模拟揭示的双核多二的膜插入 (II) 复合物:对选择性抗菌活性的影响
Daniel K Weber1,2, Marc-Antoine Sani2, Matthew T Downton1,2
1Computational Biophysics, IBM Research Australia , Melbourne, VIC 3010, Australia.
Journal of the American Chemical Society
|October 28, 2016
概括
像Rubb12这样的鲁复合物针对细菌膜进行抗菌作用. 分子动力学和核磁共振显示,Rubb12跨越细菌膜,与不活跃的类似物不同,这表明这种机制是活性的关键.
科学领域:
- 协调化学 协调化学
- 生物物理化学 生物物理化学
- 材料科学 材料科学 材料科学
背景情况:
- 双核聚二二 (II) 复合物被研究为抗菌剂.
- 复杂的吸收和效力受到链接器长度的影响,这表明膜相互作用至关重要.
- 了解这些复杂物与细菌膜的相互作用是它们作用机制的关键.
研究的目的:
- 阐明与细菌和真核细胞膜模型相互作用的多二二复合物的原子模型.
- 研究膜相互作用和复杂结构在抗菌活性中的作用.
主要方法:
- 使用了分子动力学 (MD) 模拟和固态核磁共振 (NMR) 光谱学 (P,H,C) 的组合.
- 研究了抗菌性[{Ru(phen) 2}2(μ-bb12) ]4+ (Rubb12) 和非活性[{Ir(phen) 2}2(μ-bb12) ]6+ (Irbb12) 复合体.
- 采用负电荷的细菌和中性电荷的真核细胞膜模型.
主要成果:
- 12被纳入负电荷的细菌膜中,但只与中性真核细胞膜表面相关.
- 不活跃的Irbb12只显示了与两种膜类型的表面关联.
- MD模拟和NMR数据表明,Rubb12采用膜跨度状态,嵌入脂质头组,增加乙烯链障碍和膜稀薄.
结论:
- 拉布的抗菌活性与其跨越细菌膜的能力相关.
- 一个跨白叶机制和膜跨度能力似乎对于这些复合物的细胞吸收和抗菌功效至关重要.
- 与细菌与真核细胞膜的差异性相互作用突出显示了选择性毒性的潜力.
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