单细胞RNA-seq支持人类寡头质瘤的发育层次
Itay Tirosh1, Andrew S Venteicher1,2,3, Christine Hebert1,2
1Broad Institute of Harvard and MIT, Cambridge, Massachusetts 02142, USA.
Nature
|November 5, 2016
概括
癌症干细胞 (CSCs) 驱动人体寡质瘤的生长,源自罕见的未分化细胞. 这项研究揭示了瘤结构是由发育程序塑造的, 不仅仅是基因进化.
科学领域:
- 神经瘤学
- 癌症生物学
- 基因组学
背景情况:
- 人类瘤表现出复杂的细胞层次结构,受发育途径和表观遗传程序的影响.
- 癌症干细胞 (CSC) 被假设为驱动瘤生长和分化,但人类固体恶性瘤的直接证据是有限的.
- 一种类型的脑瘤提供了一个研究这些等级模型的机会.
研究的目的:
- 在单细胞分辨率下研究人类寡质瘤中的细胞结构和发育程序.
- 提供关于癌症干细胞 (CSCs) 存在和作用的无偏见证据.
- 探索发育计划,遗传变化和瘤等级之间的相互作用.
主要方法:
- 来自6个IDH1/IDH2突变的人类寡质瘤的4347个单细胞的RNA测序 (RNA-seq).
- 使用全基因组表达签名重建发育程序.
- 对副本数量变异 (CNV) 和亚克隆点突变的分析.
主要成果:
- 大多数癌细胞的推断分化为两个专门的质程序.
- 一个罕见的,不分化的子群体表达神经干细胞程序的识别.
- 在这种罕见的亚群中增殖细胞的丰富,支持CSC模型.
- 在不同的副本数变异 (CNV) 亚克隆中观察到类似的细胞层次结构.
结论:
- 细胞结构主要是由发育程序决定的.
- 这些发现支持癌症干细胞 (CSC) 模型,其中罕见的未分化细胞推动瘤生长.
- 这些见解对了解和管理寡质瘤有重要意义.
