化学合成X染色体的虫子映射和适应性测试
Yi Wu1,2, Bing-Zhi Li1,2, Meng Zhao1,2
1Key Laboratory of Systems Bioengineering (Ministry of Education), School of Chemical Engineering and Technology, Tianjin University, Tianjin, 300072, PR China.
Science (New York, N.Y.)
|March 11, 2017
概括
合成基因组调试对于构建设计基因组至关重要. 一种新的聚合PCRTag映射 (PoPM) 方法有效地识别和纠正合成酵母X染色体 (synX) 的遗传变化,改善其功能.
科学领域:
- 合成生物学
- 基因组学
- 分子生物学
背景情况:
- 构建一个设计的真核基因组需要调试合成DNA序列.
- 酵母合成染色体X (synX),一个707,459个基对合成染色体,通过化学合成.
- SynX在各种条件下表现出强大的适应性.
研究的目的:
- 开发一种有效的策略来识别和纠正合成基因组中的遗传变化.
- 验证聚合PCRTag映射 (PoPM) 在合成染色体调试中的实用性.
主要方法:
- 酵母合成X染色体 (synX) 的化学合成
- 开发和应用聚合PCRTag映射 (PoPM) 来识别遗传变异.
- 纠正已识别的遗传错误,包括复杂的放大,重新编码的序列和与促进物相关的改变.
主要成果:
- SynX成功合成并表现出良好的健康状况.
- PoPM有效地发现了影响细胞适应性的基因变异.
- 纠正的错误包括复杂的放大,FIP1的生长缺陷和影响ATP2促进器功能的loxPsym位点.
结论:
- PoPM是一种强大且可通用的调试合成酵母基因组的工具.
- 开发的策略使合成生物学中的表型-基因型映射有效.
- 这项工作推动了设计性真核体基因组的构建.
